Общината е разположена в югозападна част на Област Пловдив. С площта си от 48.719 km2 е най-малката сред 18-те общините на областта, което съставлява 0,81% от територията на областта.

За Община Перущица са характерни две интересни особености:

тя е предпоследната по големина община в България, като зад нея е само Община Челопеч;
тя е една от 9-те общини в България, в които има само по едно населено място.
Границите на общината са следните:

на северозапад – община Стамболийски;
на изток, юг и югозапад – община Родопи;
на запад – община Кричим.
Природни ресурси
Релеф
Релефът на общината е равнинен в северната част и средно планински в южната. Територията ѝ влиза в пределите на Горнотракийската низина и крайните северни части на Западните Родопи.

Северният район на общината попада в южната част на Горнотракийската низина, като тук на границата с община Стамболийски, в коритото на река Въча се намира най-ниската ѝ точка – 184 m н.в.

Районите южно от град Перущица се заемат от крайните северни части на Върховръшкия рид, който е северозападно продължение на високия западнородопски дял Чернатица. В него, в крайната южна точка на общината, на границата с община Родопи, западно от хижа „Бряновщица“ се издига връх Свети Георги 1191 m, най-високата точка на община Перущица.

Води
От югозапад на североизток, по границата с Община Кричим и община Стамболийски протича река Въча с част от долното си течение, като в нейните предели попада десният ѝ бряг. От Върховръшкия рид на север текат малки и къси реки и дерета (най-голяма Перущинска река), водите на които излизайки от планината се отклоняват в няколко напоителни канала.