Общината се намира в югоизточната част на област Благоевград и с площта си от 327,778 km2 заема 13-о, предпоследно място сред 14-те общини на областта, което съставлява 5,09% от територията на областта. Границите ѝ са следните:

на запад – община Сандански;
на север – община Гоце Делчев и община Гърмен;
на изток – община Сатовча;
на юг – Република Гърция;
Релеф, води
Релефът на общината е разнообразен, но преобладава предимно планинския. Част от северната и централната ѝ част се заема от най-южната част на Гоцеделчевската котловина, като тук е разположен и общинския център – град Хаджидимово. Периферията на общината се заема от части от пет планини:

на северозапад – югоизточните склонове на Южен Пирин с най-висока точка връх Моторок (1971 m);
на югозапад – най-североизточната част на планината Славянка с Голям Царев връх (2183 m, най-високата точка на общината) и северните склонове на планината Стъргач с 1249 m;
на югоизток – Бесленски рид с връх Чиплекбаир (1091 m), най-северната част на планината Боздаг, разположена в Гърция;
на североизток – най-югозападните склонове на Западнородопския рид Дъбраш с най-висока точка 823 m.
Между последните два рида, в коритото на река Места, преди да навлезе на гръцка територия се намира най-ниската точка на общината – 412 m н.в.

От северозапад на югоизток, на протежение от около 27 km преминава участък от течението на река Места със своите притоци: реките Чавдар дере и Чечка Бистрица – леви и реките Топлица, Лялево дере, Мътница, Перишко дере и Селския дол – десни.